RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	NF2	P35240	595 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CASP7	P55210	303 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	G2E3	Q7L622	706 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591		H0YGN5	161 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591		H7C1W4	665 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	TAF5L	O75529	589 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	INHBE	P58166	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	SP3	Q02447	781 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ITGA6	P23229	1130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CHRND	Q07001	517 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2-208	ENST00000487591	CSF1R	P07333	972 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CTGF	P29279	349 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	RASA3	Q14644	834 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	GRIK5	Q16478	980 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	APAF1	O14727	1248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	RALBP1	Q15311	655 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	IL1R1	P14778	569 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	MTFR1	Q15390	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	COL6A3	P12111	3177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	GCKR	Q14397	625 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	MMP14	P50281	582 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	FOXO4	P98177	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms