RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 PMEPA1Q969W9 287 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 CSRNP1Q96S65 589 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 RAXQ9Y2V3 346 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.73□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 MED26O95402 600 aa6.73□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 GHRHP01286 108 aa6.73□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 IGLV1-40P01703 118 aa6.73□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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MFSD1-211ENST00000476860 MUC3BQ9H195 1237 aa6.73□□□□□ -1.33
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MFSD1-211ENST00000476860 EDN3P14138 238 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 COL19A1Q14993 1142 aa6.72□□□□□ -1.33
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MFSD1-211ENST00000476860 UVSSAQ2YD98 709 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 CEP120Q8N960 986 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 SPACA7Q96KW9 195 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 RBSNQ9H1K0 784 aa6.72□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.72□□□□□ -1.33
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MFSD1-211ENST00000476860 ACPPP15309 386 aa6.71□□□□□ -1.34
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MFSD1-211ENST00000476860 ATP11AP98196 1134 aa6.71□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.71□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.71□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 NPHS2Q9NP85 383 aa6.71□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.71□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 COBLO75128 1261 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 WISP1O95388 367 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 ATP2B2Q01814 1243 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.7□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 PPME1Q9Y570 386 aa6.7□□□□□ -1.34
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MFSD1-211ENST00000476860 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 FBF1Q8TES7 1133 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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MFSD1-211ENST00000476860 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 PBX4Q9BYU1 374 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.69□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 TXKP42681 527 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 IRAK1P51617 712 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 NFIAQ12857 509 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 OSMRQ99650 979 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 CEP41Q9BYV8 373 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 STOML1Q9UBI4 398 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.68□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 NACADO15069 1562 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 A0A1W2PP55 124 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 PRR19A6NJB7 356 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 ADAMTS4O75173 837 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 CEP135Q66GS9 1140 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 PI16Q6UXB8 463 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 DTX1Q86Y01 620 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 HHIPQ96QV1 700 aa6.67□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.67□□□□□ -1.34
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MFSD1-211ENST00000476860 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 TRPA1O75762 1119 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 FGD1P98174 961 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 LINC01387J3KSC0 135 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD1-211ENST00000476860 RNF43Q68DV7 783 aa6.65□□□□□ -1.34
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