RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCAM	P50895	628 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLA2	Q14181	598 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADORA1	P30542	326 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.83	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.83	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFCP2	Q12800	502 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCARF1	Q14162	830 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CST9	Q5W186	159 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LPIN2	Q92539	896 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	WNT10B	O00744	389 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC5A1	P13866	664 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHKA1	P46020	1223 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GUL7	405 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIMM10	P62072	90 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	VEGFB	P49765	207 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMB1	P07942	1786 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MS4A1	P11836	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDX5	P30044	214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRK	P46108	304 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21

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