RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	XDH	P47989	1333 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP3K12	Q12852	859 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	MSL1	Q68DK7	614 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	TTC14	Q96N46	770 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA3E	O15041	775 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	GPAA1	O43292	621 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMA5	P28066	241 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT32	Q14532	448 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CPA1	P15085	419 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	DDIT3	P35638	169 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	RUFY3	Q7L099	469 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TMX3	Q96JJ7	454 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	BBOX1	O75936	387 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP21A2	P08686	494 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	AK2	P54819	239 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	GPSM2	P81274	684 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TMC4	Q7Z404	712 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	PDE6B	P35913	854 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	LAMB1	P07942	1786 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB22	O15209	634 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXP2	O15409	715 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	UFL1	O94874	794 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	MBD4	O95243	580 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	NPR1	P16066	1061 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS6KB1	P23443	525 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP2B4	P23634	1241 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	NBR1	Q14596	966 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	AIDA	Q96BJ3	306 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	RAI14	Q9P0K7	980 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ABCF2	Q9UG63	623 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	GGA1	Q9UJY5	639 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	SRGN	P10124	158 aa		14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CUL4A	Q13619	759 aa		14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK1	Q96PY6	1258 aa		14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
HDLBP-231	ENST00000467435	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	MASTL	Q96GX5	879 aa		14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		14.64	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0G2JLW4	131 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP7A1	P22680	504 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NFKBIB	Q15653	356 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SP8	Q8IXZ3	490 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ARMT1	Q9H993	441 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SLX4	Q8IY92	1834 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZMYM6	O95789	1325 aa		14.63	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435		E7EWF7	191 aa		14.62	□□□□□ -0.07

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms