RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 USP26Q9BXU7 913 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL6Q8N841 843 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 WASHC4Q2M389 1173 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 PTMSP20962 102 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 PTH1RQ03431 593 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 OSBP2Q969R2 916 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 ABCF2Q9UG63 623 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 HIP1O00291 1037 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 REC8O95072 547 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 TGFB2P61812 414 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 CD209Q9NNX6 404 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPN3-209ENST00000466222 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 DOK7Q18PE1 504 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 KIF2CQ99661 725 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 M0R2C6 588 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1B0GUL6 1792 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 PDE6AP16499 860 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ADD2P35612 726 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 MED23Q9ULK4 1368 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 GRIK5Q16478 980 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 PIM2Q9P1W9 311 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 MAST3O60307 1309 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 PRDX5P30044 214 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 VPS53Q5VIR6 699 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 SLX4Q8IY92 1834 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF384Q8TF68 577 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 SPON1Q9HCB6 807 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 SEMA3EO15041 775 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 IL1R1P14778 569 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 GBP4Q96PP9 640 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 PALD1Q9ULE6 856 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 SNED1Q8TER0 1413 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 TRAK2O60296 914 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K12Q12852 859 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 RAI14Q9P0K7 980 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 FSD2A1L4K1 749 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 AOC3Q16853 763 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 APPBP2Q92624 585 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPN3-209ENST00000466222 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RAD50Q92878 1312 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RABEP1Q15276 862 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 LTBP1Q14766 1721 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 UBE3CQ15386 1083 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 GTF2IP78347 998 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC93Q567U6 631 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 MAP4K1Q92918 833 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 MXD3Q9BW11 206 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 COA1Q9GZY4 146 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 FOXP2O15409 715 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 MECOMQ03112 1051 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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