RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		21.97	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	OGFOD1	Q8N543	542 aa		21.97	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		21.97	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		21.97	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	SASH1	O94885	1247 aa		21.96	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	21.96	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	GML	Q99445	158 aa		21.96	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		21.96	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	21.95	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		21.95	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		21.95	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	PCNT	O95613	3336 aa		21.95	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	EGFR	P00533	1210 aa		21.94	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	21.94	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	TIMM10	P62072	90 aa		21.94	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		21.94	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		21.94	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		21.93	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902		F8W031	263 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF609	O15014	1411 aa		21.93	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		21.93	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GUL7	405 aa		21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	HMMR	O75330	724 aa		21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	ADORA1	P30542	326 aa		21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	CERS5	Q8N5B7	392 aa		21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	GORAB	Q5T7V8	394 aa		21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		21.91	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		21.9	■■□□□ 1.1
USP19-210	ENST00000465902	PHKA1	P46020	1223 aa		21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	SCARF1	Q14162	830 aa		21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	XAGE2	Q96GT9	111 aa		21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	CNTNAP1	P78357	1384 aa		21.88	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		21.88	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	BCL11A	Q9H165	835 aa		21.88	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		21.88	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	APBB1	O00213	710 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	TRAF5	O00463	557 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	MMP14	P50281	582 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	CCDC102B	Q68D86	513 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	GGA3	Q9NZ52	723 aa		21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	DLGAP5	Q15398	846 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	TNNI3K	Q59H18	835 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	CRBN	Q96SW2	442 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		21.86	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	USP48	Q86UV5	1035 aa		21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		21.85	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	21.84	■■□□□ 1.09	2e-6	■■■■□ 24.2
USP19-210	ENST00000465902	IFFO2	Q5TF58	517 aa		21.84	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	SULF1	Q8IWU6	871 aa		21.84	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	GPR108	Q9NPR9	543 aa		21.84	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	RASSF10	A6NK89	507 aa		21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	WNT10B	O00744	389 aa		21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	SEMA3E	O15041	775 aa		21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	CFAP100	Q494V2	611 aa		21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		21.83	■■□□□ 1.09
USP19-210	ENST00000465902	VEGFB	P49765	207 aa		21.82	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	GRIK5	Q16478	980 aa		21.82	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		21.82	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CST9	Q5W186	159 aa		21.82	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		21.82	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ADM5	C9JUS6	153 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	RASGRF1	Q13972	1273 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	MYO1B	O43795	1136 aa		21.8	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	DLK2	Q6UY11	383 aa		21.8	■■□□□ 1.08

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