RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 LARGE1O95461 756 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CSF1RP07333 972 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 IFFO2Q5TF58 517 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NBPF14Q5TI25 921 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NBPF15Q8N660 670 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 SIK1P57059 783 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 GORABQ5T7V8 394 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZUG5 572 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ILDR2Q71H61 639 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TCHHQ07283 1943 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 C4BP0C0L5 1744 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ZNF609O15014 1411 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GUL7 405 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CYP21A2P08686 494 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CPA1P15085 419 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 SASS6Q6UVJ0 657 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NECAB1Q8N987 351 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.812e-12■■■□□ 16.7
ACTB-208ENST00000464611 TNMDQ9H2S6 317 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 GDPD2Q9HCC8 539 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 RCOR1Q9UKL0 485 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 GOLIM4O00461 696 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ADCY5O95622 1261 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V1AP38606 617 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ST3GAL1Q11201 340 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TTC6Q86TZ1 520 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 RNF214Q8ND24 703 aa9.99□□□□□ -0.81
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ACTB-208ENST00000464611 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 E7EWF7 191 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 A1BGP04217 495 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 RESTQ13127 1097 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TXNRD1Q16881 649 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 APPBP2Q92624 585 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 BRF1Q92994 677 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 DYNC1I1O14576 645 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NEMFO60524 1076 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CDKL5O76039 1030 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TIMM10P62072 90 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 TRDNQ13061 729 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 BRAPQ7Z569 592 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 NCOA7Q8NI08 942 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 MTA3Q9BTC8 594 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 EP400Q96L91 3159 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQ27 194 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQ64 194 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQD8 194 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CDC25BP30305 580 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TYRO3Q06418 890 aa9.96□□□□□ -0.82
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