RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PUM2-208	ENST00000432105	TCF12	Q99081	682 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PUM2-208	ENST00000432105	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PUM2-208	ENST00000432105	TSPOAP1	O95153	1857 aa		7.02	□□□□□ -1.28
PUM2-208	ENST00000432105	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	FGFR3	P22607	806 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	FBXO24	O75426	580 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	THBS1	P07996	1170 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ITGA6	P23229	1130 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	GPLD1	P80108	840 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CEP120	Q8N960	986 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105		A0A096LPE4	126 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105		A0A1W2PPZ6	126 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ST8SIA5	O15466	376 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29	7e-6	■□□□□ 9.1
PUM2-208	ENST00000432105	FGR	P09769	529 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ITPKA	P23677	461 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	LIG3	P49916	1009 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SIK1	P57059	783 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TOP2B	Q02880	1626 aa		7	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105		F6X3S4	739 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ACPP	P15309	386 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	GRIA4	P48058	902 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PBX4	Q9BYU1	374 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CDC14C	A4D256	554 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TRPA1	O75762	1119 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RBL2	Q08999	1139 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PTPRG	P23470	1445 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	METTL12	A8MUP2	240 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105		J3QW42	95 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CELA3A	P09093	270 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	CEP135	Q66GS9	1140 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	PHC3	Q8NDX5	983 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	RHOV	Q96L33	236 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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