RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC5A1P13866 664 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP2B3Q16720 1220 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS37DQ86XT2 251 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCARF1Q14162 830 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CREBZFQ9NS37 354 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFCP2Q12800 502 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLK2Q6UY11 383 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OGFOD1Q8N543 542 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE3AQ14432 1141 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP85Q6P2H3 762 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP48Q86UV5 1035 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GGA3Q9NZ52 723 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP14P50281 582 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CST9Q5W186 159 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F8W031 263 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADORA1P30542 326 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIMM10P62072 90 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WNT10BO00744 389 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADM5C9JUS6 153 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIK5Q16478 980 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRG1Q96E93 195 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GUL7 405 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHKA1P46020 1223 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XAGE2Q96GT9 111 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC102BQ68D86 513 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SULF1Q8IWU6 871 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLGAP5Q15398 846 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP100Q494V2 611 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AOX1Q06278 1338 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB22O15209 634 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE6P0CI01 402 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNTNAP1P78357 1384 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERPINA10Q9UK55 444 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCNTO95613 3336 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASSF10A6NK89 507 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR66Q8TBY9 1149 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDCA5Q96FF9 252 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR108Q9NPR9 543 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEMA3EO15041 775 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRKP46108 304 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASGRF1Q13972 1273 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNNI3KQ59H18 835 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JMYQ8N9B5 988 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DENND2AQ9ULE3 1009 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLRN2A0PK11 232 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SALL1Q9NSC2 1324 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VEGFBP49765 207 aa30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms