RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP2B3Q16720 1220 aa31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 USP48Q86UV5 1035 aa31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 F8W031 263 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC9Q9UKV0 1011 aa31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM205AQ6ZU69 1335 aa31.01■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM88BA6NKF7 163 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TFCP2Q12800 502 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 C20orf194Q5TEA3 1177 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 DLK2Q6UY11 383 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC37L1Q7L3B6 337 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CREBZFQ9NS37 354 aa31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 POLA2Q14181 598 aa31■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GGA3Q9NZ52 723 aa31■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SSH3Q8TE77 659 aa30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TIMM10P62072 90 aa30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ADM5C9JUS6 153 aa30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ADORA1P30542 326 aa30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CST9Q5W186 159 aa30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP85Q6P2H3 762 aa30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KLRG1Q96E93 195 aa30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 WNT10BO00744 389 aa30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP14P50281 582 aa30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE3AQ14432 1141 aa30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 SULF1Q8IWU6 871 aa30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1B0GUL7 405 aa30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 DLGAP5Q15398 846 aa30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 PHKA1P46020 1223 aa30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIK5Q16478 980 aa30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP100Q494V2 611 aa30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 XAGE2Q96GT9 111 aa30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC102BQ68D86 513 aa30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH13Q9UKX3 1938 aa30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 GORABQ5T7V8 394 aa30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR66Q8TBY9 1149 aa30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 CDCA5Q96FF9 252 aa30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTNAP1P78357 1384 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 AOX1Q06278 1338 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE6P0CI01 402 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 DENND2AQ9ULE3 1009 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 CLRN2A0PK11 232 aa30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 CRKP46108 304 aa30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINA10Q9UK55 444 aa30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1-202ENST00000425695 RASSF10A6NK89 507 aa30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA3EO15041 775 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO1BO43795 1136 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 VEGFBP49765 207 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 TNNI3KQ59H18 835 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 RASGRF1Q13972 1273 aa30.8■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 VEZTQ9HBM0 779 aa30.8■■■□□ 2.52
HTATSF1-202ENST00000425695 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
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