RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416743.1

CGN-202, Transcript of cingulin, humanhuman

TSL 5

Gene CGN, Length 394 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGN-202ENST00000416743 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 SLC4A2P04920 1241 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 IL1R1P14778 569 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 CCDC27Q2M243 656 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 G2E3Q7L622 706 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 WNK4Q96J92 1243 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 FZD1Q9UP38 647 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 TRIM17Q9Y577 477 aa14.94□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 SPDYE6P0CI01 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 LINS1Q8NG48 757 aa14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.93□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 POTEFA5A3E0 1075 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 MYO1BO43795 1136 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 KCNJ4P48050 445 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 ERO1AQ96HE7 468 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 A0A1B0GUL6 1792 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 FLIIQ13045 1269 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 CFAP100Q494V2 611 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 ARMC5Q96C12 935 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.91□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 SNAP23O00161 211 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 GJA5P36382 358 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 WWC1Q8IX03 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 PTPN18Q99952 460 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 CACNA1FO60840 1977 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 IL16Q14005 1332 aa14.9□□□□□ -0.02
CGN-202ENST00000416743 TAF5LO75529 589 aa14.89□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 FOXO4P98177 505 aa14.89□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 SP3Q02447 781 aa14.89□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 CRHR2Q13324 411 aa14.89□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 CLRN2A0PK11 232 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 RASA3Q14644 834 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 EFCC1Q9HA90 598 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.88□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 F8W031 263 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 TNFAIP1Q13829 316 aa14.87□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.87□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 AOX1Q06278 1338 aa14.87□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 OTOFQ9HC10 1997 aa14.86□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 CAP1Q01518 475 aa14.86□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 OPTNQ96CV9 577 aa14.86□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 TEPSINQ96N21 525 aa14.86□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 VEZTQ9HBM0 779 aa14.86□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 VAMP4O75379 141 aa14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 BEND3Q5T5X7 828 aa14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 ZNF333Q96JL9 665 aa14.85□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 UBE4AQ14139 1066 aa14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 ARHGEF6Q15052 776 aa14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CGN-202ENST00000416743 GTF2A2P52657 109 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 NBPF11Q86T75 865 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ELP3Q9H9T3 547 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.83□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 JAG2Q9Y219 1238 aa14.82□□□□□ -0.04
CGN-202ENST00000416743 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms