RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.71■■□□□ 1.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.7■■□□□ 1.7
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SH3BP5-204ENST00000412806 ARMT1Q9H993 441 aa25.59■■□□□ 1.69
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SH3BP5-204ENST00000412806 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 LCORLQ8N3X6 602 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 RAI14Q9P0K7 980 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 STX6O43752 255 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP7A1P22680 504 aa25.55■■□□□ 1.68
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