RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENPP3O14638 875 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 BNIP3LO60238 219 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRPA1O75762 1119 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRKP46108 304 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM182BQ5T319 152 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 BHMTQ93088 406 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GMCL1Q96IK5 515 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SHDQ96IW2 340 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC30A3Q99726 388 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 HCN2Q9UL51 889 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC35F4A4IF30 521 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 METTL12A8MUP2 240 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAN1A2O60476 641 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SIK1P57059 783 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPLD1P80108 840 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAAP100Q0VG06 881 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEUROD1Q13562 356 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNNI3KQ59H18 835 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PBX4Q9BYU1 374 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SAMM50Q9Y512 469 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAGE1O75459 146 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 RASA3Q14644 834 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCSK7Q16549 785 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 DBN1Q16643 649 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 HHIPQ96QV1 700 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNTG2Q9NY99 539 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM221AA4D161 298 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGAT1O75907 488 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 RGS20O76081 388 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 F13A1P00488 732 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD33P20138 364 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 BMP6P22004 513 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 GIPRP48546 466 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTSQ03393 145 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 MPP2Q14168 576 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEZ6Q53EL9 994 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 AXIN1O15169 862 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 LMNB1P20700 586 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF165P49910 485 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 BSNDQ8WZ55 320 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBSNQ9H1K0 784 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPT2Q9UMR5 302 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 J3QW42 95 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CILPO75339 1184 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 IMPDH2P12268 514 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 NME2P22392 152 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC14Q15048 493 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO27Q8NI29 283 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNB2Q92953 911 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRBNQ96SW2 442 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 MUC3BQ9H195 1237 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHF24Q9UPV7 400 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 B3GALT4O96024 378 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 GHRHP01286 108 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGFR3P22607 806 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCM4P33991 863 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP11AP98196 1134 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms