RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.54■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 DOCK2Q92608 1830 aa22.54■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.54■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 E7EWF7 191 aa22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 CNBD1Q8NA66 436 aa22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 LAMA4Q16363 1823 aa22.53■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 FOXP2O15409 715 aa22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.52■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 FGAP02671 866 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 MCTP1Q6DN14 999 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 Q6ZUG5 572 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 GYS1P13807 737 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 TM4SF1P30408 202 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 TXNRD1Q16881 649 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 NECAB1Q8N987 351 aa22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 A0A0G2JLW4 131 aa22.5■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 GYG1P46976 350 aa22.5■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.5■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 GJB2P29033 226 aa22.49■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 FGD1P98174 961 aa22.49■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 ST3GAL1Q11201 340 aa22.49■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 VPS37DQ86XT2 251 aa22.49■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 AIDAQ96BJ3 306 aa22.49■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.48■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 ZNF213O14771 459 aa22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 HAND2P61296 217 aa22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 PROM2Q8N271 834 aa22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 STX6O43752 255 aa22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 APPP05067 770 aa22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 SYT1P21579 422 aa22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 ST5P78524 1137 aa22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 BRF1Q92994 677 aa22.46■■□□□ 1.19
USP39-202ENST00000409025 SERPINB2P05120 415 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 GRAPQ13588 217 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 SEMA3EO15041 775 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PLSCR1O15162 318 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 STK3Q13188 491 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.45■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 GTF3C6Q969F1 213 aa22.44■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.44■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 MBD4O95243 580 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ALX1Q15699 326 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 NCOA7Q8NI08 942 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 APBA3O96018 575 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 RXRBP28702 533 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ABCF2Q9UG63 623 aa22.43■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ZMYM6O95789 1325 aa22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 GNAT2P19087 354 aa22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ARMT1Q9H993 441 aa22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 RAI14Q9P0K7 980 aa22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PDCP20941 246 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 FBXL16Q8N461 479 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 KLRK1P26718 216 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 MCM5P33992 734 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.41■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 PFKFB2O60825 505 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 CYP7A1P22680 504 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 APOBRQ0VD83 1088 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 TRDNQ13061 729 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 CRY2Q49AN0 593 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.4■■□□□ 1.18
USP39-202ENST00000409025 F13A1P00488 732 aa22.39■■□□□ 1.18
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