RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 SCARF1Q14162 830 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF827Q17R98 1081 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 VPS53Q5VIR6 699 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PI16Q6UXB8 463 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SMIM5Q71RC9 77 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMC4Q7Z404 712 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAP4K1Q92918 833 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 IL17RAQ96F46 866 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZMYM6O95789 1325 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDE6AP16499 860 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 GNAT2P19087 354 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADD2P35612 726 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TDO2P48775 406 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 AK2P54819 239 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRDNQ13061 729 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 UBE3CQ15386 1083 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NFKBIBQ15653 356 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RUFY3Q7L099 469 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMX3Q96JJ7 454 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAI14Q9P0K7 980 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SCN9AQ15858 1988 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 UFL1O94874 794 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 MBD4O95243 580 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 APPP05067 770 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RPS6KB1P23443 525 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDE6BP35913 854 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 GYG1P46976 350 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 DDR1Q08345 913 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NECTIN1Q15223 517 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 AKT1S1Q96B36 256 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NEK1Q96PY6 1258 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NAPBQ9H115 298 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ABCF2Q9UG63 623 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 KIF3AQ9Y496 699 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NPR1P16066 1061 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATP2B4P23634 1241 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 BCAMP50895 628 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 CRY2Q49AN0 593 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 RASEFQ8IZ41 740 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NCOA7Q8NI08 942 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 KCNB2Q92953 911 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 OSBP2Q969R2 916 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 TTC14Q96N46 770 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 GGA1Q9UJY5 639 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 EP400Q96L91 3159 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms