RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 GNPTABQ3T906 1256 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PLA2R1Q13018 1463 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 VCAM1P19320 739 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 FAM182BQ5T319 152 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 SPATA17Q96L03 361 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 F6X3S4 739 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CERKQ8TCT0 537 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 C8orf34Q49A92 452 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 TMC6Q7Z403 805 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 BICD2Q8TD16 824 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 NEMFO60524 1076 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CFAP45Q9UL16 551 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ADCY2Q08462 1091 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CAGE1Q8TC20 777 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 EXOC1Q9NV70 894 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 POTEB2H3BUK9 544 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 APBA3O96018 575 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PSMD7P51665 324 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 POLE2P56282 527 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 SRGAP3O43295 1099 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 GJA8P48165 433 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.55■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ISM2Q6H9L7 571 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 MPP4Q96JB8 637 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 RAD50Q92878 1312 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 DMPKQ09013 629 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 VCXQ9H320 206 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PNMA2Q9UL42 364 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CCDC160A6NGH7 325 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 NDUFAB1O14561 156 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CRYMQ14894 314 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 VPS53Q5VIR6 699 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 EXOC4Q96A65 974 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ODF2Q5BJF6 829 aa15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 OATP04181 439 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CUL3Q13618 768 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 SNCBQ16143 134 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CCDC96Q2M329 555 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CCDC38Q502W7 563 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ARMC3Q5W041 872 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 SPATA24Q86W54 205 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WZG4 1122 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 BRINP3Q76B58 766 aa15.53■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 11.8
CTIF-202ENST00000382998 RXRBP28702 533 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 MTRQ99707 1265 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 DNAI1Q9UI46 699 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 TULP2O00295 520 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 FIBPO43427 364 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CTIF-202ENST00000382998 KLHL33A6NCF5 533 aa15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 ZNF445P59923 1031 aa15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.52■□□□□ 0.07
CTIF-202ENST00000382998 C6orf229H3BNL8 230 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.2 ms