RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 ME1P48163 572 aa14.9□□□□□ -0.02
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CTPS1-202ENST00000372621 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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CTPS1-202ENST00000372621 ANO10Q9NW15 660 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-202ENST00000372621 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-202ENST00000372621 NEDD4P46934 1319 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-202ENST00000372621 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
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CTPS1-202ENST00000372621 TCIRG1Q13488 830 aa14.89□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.88□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.88□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 A0A1B0GVL5 298 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 BECN2A8MW95 431 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 ZAP70P43403 619 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 WASHC4Q2M389 1173 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 C8orf76Q96K31 380 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 CCZ1BP86790 482 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 BRAPQ7Z569 592 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 NCOA7Q8NI08 942 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 KCND1Q9NSA2 647 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 ATP2B3Q16720 1220 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 GORABQ5T7V8 394 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 NBPF11Q86T75 865 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 NBPF3Q9H094 633 aa14.85□□□□□ -0.03
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CTPS1-202ENST00000372621 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 USP27XA6NNY8 438 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 KIF28PB7ZC32 967 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 GPAA1O43292 621 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 PI16Q6UXB8 463 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 ATRNO75882 1429 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 IL2RBP14784 551 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 FAM89AQ96GI7 184 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 MYH3P11055 1940 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 SPTLC2O15270 562 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-202ENST00000372621 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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