RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361909.8

CMTM3-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-201ENST00000361909 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 MAP4K1Q92918 833 aa22.22■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.21■■□□□ 1.15
CMTM3-201ENST00000361909 TCIRG1Q13488 830 aa22.21■■□□□ 1.15
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CMTM3-201ENST00000361909 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.2■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 USP27XA6NNY8 438 aa22.2■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 BECN2A8MW95 431 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 RPS6KB1P23443 525 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 CASP7P55210 303 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 PDE4CQ08493 712 aa22.19■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 ATP8B1O43520 1251 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 RESTQ13127 1097 aa22.18■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 SLC27A2O14975 620 aa22.18■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 TEX35Q5T0J7 233 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 KRT32Q14532 448 aa22.16■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM3-201ENST00000361909 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.15■■□□□ 1.14
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CMTM3-201ENST00000361909 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.14■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 MED23Q9ULK4 1368 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 SBF2Q86WG5 1849 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.13■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.13■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 KINO60870 393 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.12■■□□□ 1.13
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CMTM3-201ENST00000361909 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 NUP98P52948 1817 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 H3BQV1 296 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 CLCN6P51797 869 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 IFFO2Q5TF58 517 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-201ENST00000361909 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
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