RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SASH1O94885 1247 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A1P11836 297 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ATP8B2P98198 1209 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ATP2B3Q16720 1220 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 VPS37DQ86XT2 251 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CREBZFQ9NS37 354 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 GGA3Q9NZ52 723 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 F8W031 263 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TFCP2Q12800 502 aa18.54■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SCARF1Q14162 830 aa18.54■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SSH3Q8TE77 659 aa18.54■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.54■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ADM5C9JUS6 153 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ADORA1P30542 326 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CEP85Q6P2H3 762 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 USP48Q86UV5 1035 aa18.53■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 WNT10BO00744 389 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 GRIK5Q16478 980 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CST9Q5W186 159 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OGFOD1Q8N543 542 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 KLRG1Q96E93 195 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.52■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.51■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.51■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PHKA1P46020 1223 aa18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM10P62072 90 aa18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GUL7 405 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PDE3AQ14432 1141 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 AOX1Q06278 1338 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CNTNAP1P78357 1384 aa18.48■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MMP14P50281 582 aa18.48■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP100Q494V2 611 aa18.48■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.48■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC102BQ68D86 513 aa18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SULF1Q8IWU6 871 aa18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 XAGE2Q96GT9 111 aa18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DLGAP5Q15398 846 aa18.46■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.46■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CDCA5Q96FF9 252 aa18.46■□□□□ 0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RASSF10A6NK89 507 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE6P0CI01 402 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.45■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RASGRF1Q13972 1273 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 JMYQ8N9B5 988 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CLRN2A0PK11 232 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CRKP46108 304 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 VEGFBP49765 207 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TNNI3KQ59H18 835 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.43■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SEMA3EO15041 775 aa18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PRDX5P30044 214 aa18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GPR108Q9NPR9 543 aa18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.42■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB22O15209 634 aa18.41■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PI16Q6UXB8 463 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms