RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TPGS1-201ENST00000359315 TFCP2Q12800 502 aa33.51■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 CAVIN4Q5BKX8 364 aa33.51■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 CEP85Q6P2H3 762 aa33.51■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 SSH3Q8TE77 659 aa33.51■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 FAM205AQ6ZU69 1335 aa33.51■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 VPS37DQ86XT2 251 aa33.5■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 GGA3Q9NZ52 723 aa33.5■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 F8W031 263 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 ADORA1P30542 326 aa33.49■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 DDX19BQ9UMR2 479 aa33.48■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 SCARF1Q14162 830 aa33.47■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa33.47■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 PDE3AQ14432 1141 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 GRIK5Q16478 980 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF9Q3BBW0 867 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 OGFOD1Q8N543 542 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa33.46■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 ADM5C9JUS6 153 aa33.45■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 TIMM10P62072 90 aa33.45■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD14BQ5SR56 506 aa33.45■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 USP48Q86UV5 1035 aa33.45■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 CREBZFQ9NS37 354 aa33.45■■■□□ 2.95
TPGS1-201ENST00000359315 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GUL7 405 aa33.43■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 WNT10BO00744 389 aa33.43■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 PHKA1P46020 1223 aa33.43■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 CDC37L1Q7L3B6 337 aa33.43■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM88BA6NKF7 163 aa33.42■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 CST9Q5W186 159 aa33.42■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 KRT26Q7Z3Y9 468 aa33.42■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 HDAC9Q9UKV0 1011 aa33.42■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 SURF6O75683 361 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 CEP350Q5VT06 3117 aa33.4■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 AOX1Q06278 1338 aa33.4■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 RRP1P56182 461 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 SIRT2Q8IXJ6 389 aa33.39■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC102BQ68D86 513 aa33.38■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 XAGE2Q96GT9 111 aa33.38■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 CELF2O95319 508 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 KLRG1Q96E93 195 aa33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF408Q9H9D4 720 aa33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP2Q9Y2D5 859 aa33.37■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 ARAP2Q8WZ64 1704 aa33.36■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP100Q494V2 611 aa33.36■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 SULF1Q8IWU6 871 aa33.35■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 NEUROD6Q96NK8 337 aa33.35■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa33.35■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 MMP14P50281 582 aa33.34■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 DLGAP5Q15398 846 aa33.34■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa33.33■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR14Q8NCE2 650 aa33.33■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa33.33■■■□□ 2.93
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE2BA6NHP3 402 aa33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE6P0CI01 402 aa33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 RASGRF1Q13972 1273 aa33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 TNNI3KQ59H18 835 aa33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa33.32■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 CDCA5Q96FF9 252 aa33.31■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 CNTNAP1P78357 1384 aa33.31■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa33.3■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 CLRN2A0PK11 232 aa33.29■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 CRKP46108 304 aa33.29■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 WDR66Q8TBY9 1149 aa33.29■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 DBNDD2Q9BQY9 259 aa33.29■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 PRDX5P30044 214 aa33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 GPR108Q9NPR9 543 aa33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINA10Q9UK55 444 aa33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 DENND2AQ9ULE3 1009 aa33.28■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA3EO15041 775 aa33.27■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 PI16Q6UXB8 463 aa33.27■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 TLL2Q9Y6L7 1015 aa33.27■■■□□ 2.92
TPGS1-201ENST00000359315 RASSF10A6NK89 507 aa33.26■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB22O15209 634 aa33.25■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 GORABQ5T7V8 394 aa33.24■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 SAPCD2Q86UD0 394 aa33.24■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 SALL1Q9NSC2 1324 aa33.24■■■□□ 2.91
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