RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 STX6O43752 255 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SKILP12757 684 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DDB1Q16531 1140 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ST5P78524 1137 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FERMT2Q96AC1 680 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SMC6Q96SB8 1091 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SLC26A4O43511 780 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LDHCP07864 332 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 GSTO1P78417 241 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HAUS8Q9BT25 410 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ACEP12821 1306 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CEP63Q96MT8 703 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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PTPRD-201ENST00000355233 OTUD6BQ8N6M0 293 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 UBE4BO95155 1302 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RFX7Q2KHR2 1363 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ALDH1L1O75891 902 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 BAG6P46379 1132 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DRP2Q13474 957 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 IQCA1Q86XH1 822 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 EVCP57679 992 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DNAI1Q9UI46 699 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 IL2RBP14784 551 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 IFT20Q8IY31 132 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf76Q96K31 380 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LNPKQ9C0E8 428 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DISP1Q96F81 1524 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FLOT1O75955 427 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB13Q8IY85 973 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 BBOF1Q8ND07 529 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA5Q8TBA6 731 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ATP7BP35670 1465 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MED14O60244 1454 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 THAP12O43422 761 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5HO75947 161 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 STMN1P16949 149 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ6P48051 423 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PSMD7P51665 324 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-201ENST00000355233 NAA25Q14CX7 972 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 POLE3Q9NRF9 147 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0232Q92628 1395 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 STX10O60499 249 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SPZ1Q9BXG8 430 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO3Q9UK99 471 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RAD21O60216 631 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SLC4A2P04920 1241 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ACTN2P35609 894 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
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