RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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PTDSS1-201ENST00000337004 SDF4Q9BRK5 362 aa25.08■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 SPEF2Q9C093 1822 aa25.08■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 PRC1O43663 620 aa25.08■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 TNNT1P13805 278 aa25.08■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ADORA1P30542 326 aa25.08■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 HAND2P61296 217 aa25.08■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.08■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.08■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA7Q8NI08 942 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.07■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 SMTNL1A8MU46 457 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 STK38Q15208 465 aa25.06■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.05■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF213O14771 459 aa25.05■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 YEATS4O95619 227 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 BRAPQ7Z569 592 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 TJP1Q07157 1748 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCC12Q96J65 1359 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 IL2RBP14784 551 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ZAP70P43403 619 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.04■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1B0GVL5 298 aa25.03■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.03■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD7Q92527 254 aa25.03■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFA8P51970 172 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 SCARF1Q14162 830 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM89AQ96GI7 184 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.01■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 TNS2Q63HR2 1409 aa25.01■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A087WWV3 80 aa25.01■■□□□ 1.59
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PTDSS1-201ENST00000337004 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 UBR2Q8IWV8 1755 aa25■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP2B3Q16720 1220 aa25■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC112Q8NEF3 446 aa25■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 CARD10Q9BWT7 1032 aa25■■□□□ 1.59
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PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL24Q5JXM2 366 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP135Q66GS9 1140 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXW7Q969H0 707 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO1Q5XXA6 986 aa24.97■■□□□ 1.59
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