RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 C21orf2O43822 256 aa22.07■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 OLFM4Q6UX06 510 aa22.07■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SLC51AQ86UW1 340 aa22.07■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.07■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 UBE3CQ15386 1083 aa22.06■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 PSMD1Q99460 953 aa22.06■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.06■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 PODNQ7Z5L7 613 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SLX4Q8IY92 1834 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SNED1Q8TER0 1413 aa22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 LTBP1Q14766 1721 aa22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 USP26Q9BXU7 913 aa22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.03■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 FAM227BQ96M60 508 aa22.03■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.03■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 ADD2P35612 726 aa22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 KLHL34Q8N239 644 aa22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 APPBP2Q92624 585 aa22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FRMD1-202ENST00000336070 A0A0D9SFI3 127 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 G3V3G9 751 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 RIMBP2O15034 1052 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 ABCF2Q9UG63 623 aa22.02■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.01■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.01■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.01■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 AK9Q5TCS8 1911 aa22■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 PDE6AP16499 860 aa21.99■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 IL25Q9H293 177 aa21.99■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.99■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 RAI14Q9P0K7 980 aa21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 OSBP2Q969R2 916 aa21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 MCCP23508 829 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 MAP4K1Q92918 833 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 BCS1LQ9Y276 419 aa21.97■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FRMD1-202ENST00000336070 PPIP5K2O43314 1243 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 DOK7Q18PE1 504 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 MAST3O60307 1309 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 GTF2IP78347 998 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 GSTO1P78417 241 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 AOC3Q16853 763 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 CHGBP05060 677 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 ANAPC15P60006 121 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 IL27Q8NEV9 243 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 ECE2O60344 883 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 LDHCP07864 332 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 CYP7A1P22680 504 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 PRDX5P30044 214 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 MECOMQ03112 1051 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 SLF2Q8IX21 1173 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 AIDAQ96BJ3 306 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 SYT17Q9BSW7 474 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 CACNA1SQ13698 1873 aa21.92■■□□□ 1.1
FRMD1-202ENST00000336070 SOCS7O14512 581 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms