RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 ME1P48163 572 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 FOSBP53539 338 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 SYCP1Q15431 976 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 SMTNL1A8MU46 457 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 YEATS4O95619 227 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 APPBP2Q92624 585 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 TCIRG1Q13488 830 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 CHST3Q7LGC8 479 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 XAGE2Q96GT9 111 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 BECN2A8MW95 431 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 GUCY1B3Q02153 619 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 BRAPQ7Z569 592 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 MYH7P12883 1935 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 PRC1O43663 620 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 FGAP02671 866 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 ADORA1P30542 326 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 CSF1RP07333 972 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 C8orf76Q96K31 380 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 KCND1Q9NSA2 647 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 ATRNO75882 1429 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 NEDD4P46934 1319 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 TNNT1P13805 278 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 C4AP0C0L4 1744 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 C4BP0C0L5 1744 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 ANTXR2P58335 489 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 GORABQ5T7V8 394 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA7Q8NI08 942 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 WASHC4Q2M389 1173 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 FAM177BA6PVY3 158 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 SCARF1Q14162 830 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD1-201ENST00000331462 IL2RBP14784 551 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 STK38Q15208 465 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ZAP70P43403 619 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFA8P51970 172 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 HAND2P61296 217 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CLIC4Q9Y696 253 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 SPTLC2O15270 562 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 GPAA1O43292 621 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 GSDMDP57764 484 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CCZ1BP86790 482 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 SDF4Q9BRK5 362 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 PPFIA3O75145 1194 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GVL5 298 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF213O14771 459 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC69A6NI79 296 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 SKILP12757 684 aa26.22■■□□□ 1.79
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