RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.98■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 TSG101Q99816 390 aa18.98■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 STAP2Q9UGK3 403 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 ZSCAN12O43309 604 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM87BQ96K49 555 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 PTCH1Q13635 1447 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO3Q9UK99 471 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.97■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 SPTLC2O15270 562 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 GPAA1O43292 621 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 COPRSQ9NQ92 184 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 AGLP35573 1532 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 CBX1P83916 185 aa18.96■□□□□ 0.63
ITGA3-202ENST00000320031 CALML3P27482 149 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 TRAF1Q13077 416 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 CDR1P51861 262 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 PTPN14Q15678 1187 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 EYA3Q99504 573 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 PROSER3Q2NL68 480 aa18.95■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 CTSWP56202 376 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 NCAPD2Q15021 1401 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 DLC1Q96QB1 1528 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 MYO6Q9UM54 1294 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 USP31Q70CQ4 1352 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM75PA6NK02 468 aa18.94■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 MYO1BO43795 1136 aa18.93■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC27Q9C0I9 530 aa18.93■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.93■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.93■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.93■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 TAF3Q5VWG9 929 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 FEZ1Q99689 392 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 RMND1Q9NWS8 449 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 F8W031 263 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ZAP70P43403 619 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.92■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA5Q8NB90 893 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 USP21Q9UK80 565 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1328Q86T90 577 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 PTPRMP28827 1452 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC181Q5TID7 509 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 CERS3Q8IU89 383 aa18.91■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 B4E1Z4 1266 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 OGFOD1Q8N543 542 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 ARMT1Q9H993 441 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 PICALMQ13492 652 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 KIF18AQ8NI77 898 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 HAUS7Q99871 368 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 TAF5LO75529 589 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 TMC6Q7Z403 805 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.9■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.89■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 KRT2P35908 639 aa18.89■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 IQCEQ6IPM2 695 aa18.89■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 GPR108Q9NPR9 543 aa18.89■□□□□ 0.62
ITGA3-202ENST00000320031 C6orf50Q9HD87 102 aa18.89■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 NAPAP54920 295 aa18.89■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 TTC6Q86TZ1 520 aa18.89■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 ERLIN1O75477 346 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 IDEP14735 1019 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 TYRO3Q06418 890 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 UFL1O94874 794 aa18.88■□□□□ 0.61
ITGA3-202ENST00000320031 SPA17Q15506 151 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms