RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 BCS1LQ9Y276 419 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 DOCK2Q92608 1830 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 HIP1O00291 1037 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 COA1Q9GZY4 146 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 IL1R1P14778 569 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 G3V3G9 751 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 PSMD1Q99460 953 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 SEC24BO95487 1268 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 TICAM2Q86XR7 235 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 SYT17Q9BSW7 474 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU2-201ENST00000312060 DOK7Q18PE1 504 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.879e-8■■■□□ 18
CTU2-201ENST00000312060 ABCF2Q9UG63 623 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 AOC3Q16853 763 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.74■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.74■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 JAG2Q9Y219 1238 aa26.74■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 PPIP5K2O43314 1243 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 CHGBP05060 677 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 FAM227BQ96M60 508 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K12Q12852 859 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 PODNQ7Z5L7 613 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.72■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 VPS33BQ9H267 617 aa26.72■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.72■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 A0A0D9SFI3 127 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 SGSM2O43147 1006 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 ADD2P35612 726 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 IL25Q9H293 177 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-201ENST00000312060 SCN9AQ15858 1988 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 ECE2O60344 883 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 GTF2IP78347 998 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 RAI14Q9P0K7 980 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 NFKBIEO00221 500 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 REC8O95072 547 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 PDE6AP16499 860 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 UBE3CQ15386 1083 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 RAD50Q92878 1312 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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CTU2-201ENST00000312060 FBXW7Q969H0 707 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 PRDX5P30044 214 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 OSBP2Q969R2 916 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.65■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 PSME4Q14997 1843 aa26.65■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.65■■□□□ 1.86
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CTU2-201ENST00000312060 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.64■■□□□ 1.86
CTU2-201ENST00000312060 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.64■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.64■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 IGSF3O75054 1194 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 MECOMQ03112 1051 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.63■■□□□ 1.85
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