RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.64□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ENPP3O14638 875 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RFC5P40937 340 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CASP2P42575 452 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 GNAI1P63096 354 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SYCP1Q15431 976 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SLF2Q8IX21 1173 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 FRS2Q8WU20 508 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 GMLQ99445 158 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ERC2O15083 957 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PPFIA3O75145 1194 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 DCTN1Q14203 1278 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.63□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CDHR1Q96JP9 859 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ZNF853P0CG23 659 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NEFHP12036 1026 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SDSP20132 328 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 FERMT3Q86UX7 667 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TTC30AQ86WT1 665 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RELL1Q8IUW5 271 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD7Q92527 254 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TMX3Q96JJ7 454 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CHST12Q9NRB3 414 aa10.62□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CBX1P83916 185 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 E2F5Q15329 346 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RNF214Q8ND24 703 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TGIF2Q9GZN2 237 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SLAIN2Q9P270 581 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.61□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 A6NJY4 79 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NAT2P11245 290 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SERPINB4P48594 390 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PDXDC1Q6P996 788 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PTPRUQ92729 1446 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RPN1P04843 607 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 MX1P20591 662 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 SEPT2Q15019 361 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 IQCEQ6IPM2 695 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 STK26Q9P289 416 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 USP25Q9UHP3 1055 aa10.6□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 RTL1A6NKG5 1358 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 FYB1O15117 783 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ADCY5O95622 1261 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 BPNT1O95861 308 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 NEK4P51957 841 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R5AQ15172 486 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ATP2B3Q16720 1220 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 ATRIPQ8WXE1 791 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 OGFRQ9NZT2 677 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 INTUQ9ULD6 942 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 A0A1W2PP64 1363 aa10.59□□□□□ -0.71
MMP3-201ENST00000299855 TNFRSF10BO14763 440 aa10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 LMNB1P20700 586 aa10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 ZNF132P52740 706 aa10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 TAF11Q15544 211 aa10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.58□□□□□ -0.72
MMP3-201ENST00000299855 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms