RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298119.8

LRFN5-201, Transcript of leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRFN5, Length 3,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5-201ENST00000298119 IGKV5-2P06315 115 aa14.73□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 ABCC3O15438 1527 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 GLI2P10070 1586 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 FANCCQ00597 558 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.72□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 NEK11Q8NG66 645 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 PLXNC1O60486 1568 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 GPAA1O43292 621 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 EVCP57679 992 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 CABP5Q9NP86 173 aa14.71□□□□□ -0.05
LRFN5-201ENST00000298119 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.71□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 FGAP02671 866 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CASP1P29466 404 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 FANCLQ9NW38 375 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 GSDMDP57764 484 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 POLA2Q14181 598 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 XAGE2Q96GT9 111 aa14.7□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 SMARCE1Q969G3 411 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 OGFRQ9NZT2 677 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ANO1Q5XXA6 986 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 PSMB7Q99436 277 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ARMT1Q9H993 441 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CBFA2T2O43439 604 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 PFKFB1P16118 471 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TERF1P54274 439 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TAF3Q5VWG9 929 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CPS1P31327 1500 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CHD1O14646 1710 aa14.69□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 VPS16Q9H269 839 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 N4BP3O15049 544 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 OSBP2Q969R2 916 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TET3O43151 1660 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 MED14O60244 1454 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.68□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 BTBD18B2RXH4 712 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CDKL5O76039 1030 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ZNF174Q15697 407 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 XBP1P17861 261 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CDC25AP30304 524 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 KRT40Q6A162 431 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 EYA2O00167 538 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ATP5JP18859 108 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.67□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 M0R2C6 588 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ZSCAN12O43309 604 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 CEP152O94986 1710 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 MBD4O95243 580 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 ADAMTS2O95450 1211 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.66□□□□□ -0.06
LRFN5-201ENST00000298119 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms