RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PDE3AQ14432 1141 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRRC24Q50LG9 513 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NIM1KQ8IY84 436 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EYA3Q99504 573 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COG6Q9Y2V7 657 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPEF2Q9C093 1822 aa9.53□□□□□ -0.88
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 YDJCA8MPS7 323 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TAF5LO75529 589 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MED23Q9ULK4 1368 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POTECB2RU33 542 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SRGAP3O43295 1099 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KLRK1P26718 216 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.52□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EYA2O00167 538 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KIF3CO14782 793 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ECE2O60344 883 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CXCL9Q07325 125 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPC2Q8N158 579 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COPRSQ9NQ92 184 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FBXO3Q9UK99 471 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CIAO1O76071 339 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RRAGCQ9HB90 399 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A1B0GUL6 1792 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RAD17O75943 681 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PDE8BO95263 885 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATP8B2P98198 1209 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UBE4AQ14139 1066 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 METTL24Q5JXM2 366 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SIL1Q9H173 461 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KCNJ4P48050 445 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SCNN1DP51172 638 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CEP85Q6P2H3 762 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PODNQ7Z5L7 613 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SSH3Q8TE77 659 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COA1Q9GZY4 146 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WDR90Q96KV7 1748 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FGFR2P21802 821 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SCN9AQ15858 1988 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PSMD14O00487 310 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNIP1Q15025 636 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CD209Q9NNX6 404 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LAPTM4AQ15012 233 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP17L3A6NCW0 530 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP17L4A6NCW7 530 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IL1R1P14778 569 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EPS15P42566 896 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GYG1P46976 350 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HACL1Q9UJ83 578 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TOMM70O94826 608 aa9.45□□□□□ -0.9
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SASH1O94885 1247 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms