RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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ARPC5-201ENST00000294742 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.17■□□□□ 0.82
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ARPC5-201ENST00000294742 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.16■□□□□ 0.82
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ARPC5-201ENST00000294742 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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ARPC5-201ENST00000294742 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.14■□□□□ 0.81
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ARPC5-201ENST00000294742 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.14■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 F8W031 263 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 PDE6AP16499 860 aa20.13■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 TNIP1Q15025 636 aa20.13■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.13■□□□□ 0.81
ARPC5-201ENST00000294742 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.13■□□□□ 0.81
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