RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 RTL9Q8NET4 1388 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 NEO1Q92859 1461 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 APPBP2Q92624 585 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 SYNMO15061 1565 aa20.09■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 STX17P56962 302 aa20.04■□□□□ 0.8
SCARB2-201ENST00000264896 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
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SCARB2-201ENST00000264896 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.03■□□□□ 0.8
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SCARB2-201ENST00000264896 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SCARB2-201ENST00000264896 DTNBO60941 627 aa20.02■□□□□ 0.8
SCARB2-201ENST00000264896 BEND3Q5T5X7 828 aa20.02■□□□□ 0.8
SCARB2-201ENST00000264896 ME3Q16798 604 aa20.01■□□□□ 0.79
SCARB2-201ENST00000264896 CTR9Q6PD62 1173 aa20.01■□□□□ 0.79
SCARB2-201ENST00000264896 CBX8Q9HC52 389 aa20.01■□□□□ 0.79
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