RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.546e-7■■□□□ 13.3
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CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.66■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 UTYO14607 1347 aa24.66■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM232C9JQI7 657 aa24.65■■□□□ 1.54
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NEK11Q8NG66 645 aa24.65■■□□□ 1.54
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.64■■□□□ 1.54
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CSNK1G2-201ENST00000255641 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.63■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC93Q567U6 631 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 M0R2C6 588 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 COPRSQ9NQ92 184 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 MST1RQ04912 1400 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADALQ6DHV7 355 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPTLC2O15270 562 aa24.61■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.61■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.61■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAST3O60307 1309 aa24.6■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.6■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNOCQ13519 176 aa24.6■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.6■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.6■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ST5P78524 1137 aa24.59■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBXN4Q92575 508 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP100Q494V2 611 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC24Q50LG9 513 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLIC6Q96NY7 704 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.58■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINC1P01008 464 aa24.58■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.58■■□□□ 1.53
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.58■■□□□ 1.53
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
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CSNK1G2-201ENST00000255641 TIGD1Q96MW7 591 aa24.58■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.58■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.57■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSBP2Q969R2 916 aa24.57■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 SASH3O75995 380 aa24.57■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAPN2P17655 700 aa24.57■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC66A2RUB6 948 aa24.56■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXN1O15353 648 aa24.56■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBASH3AP57075 661 aa24.56■■□□□ 1.52
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRP12P59046 1061 aa24.56■■□□□ 1.52
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