RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 GOLIM4O00461 696 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 CBX1P83916 185 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 ELP1O95163 1332 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 TYRO3Q06418 890 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.74■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 PDCP20941 246 aa23.73■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 ERFEQ4G0M1 354 aa23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 GORABQ5T7V8 394 aa23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 TRIM37O94972 964 aa23.73■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 AK7Q96M32 723 aa23.72■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 SNRKQ9NRH2 765 aa23.72■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 HIP1O00291 1037 aa23.72■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.72■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 ZPR1O75312 459 aa23.71■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 CAMK4Q16566 473 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 ATP2B3Q16720 1220 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 FERMT3Q86UX7 667 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 PSMA5P28066 241 aa23.71■■□□□ 1.39
VGF-201ENST00000249330 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.71■■□□□ 1.39
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VGF-201ENST00000249330 LUZP1Q86V48 1076 aa23.7■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 PDE8BO95263 885 aa23.7■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.7■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 ANKRD7Q92527 254 aa23.7■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.69■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 PI16Q6UXB8 463 aa23.69■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.69■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 SETDB2Q96T68 719 aa23.67■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 DACT1Q9NYF0 836 aa23.67■■□□□ 1.38
VGF-201ENST00000249330 LY75O60449 1722 aa23.67■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 SLC27A2O14975 620 aa23.66■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.66■■□□□ 1.38
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VGF-201ENST00000249330 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.64■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
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VGF-201ENST00000249330 C4BP0C0L5 1744 aa23.63■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.63■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
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