RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

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Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 GTF3C6Q969F1 213 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 BCAMP50895 628 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 SETDB2Q96T68 719 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 NYXQ9GZU5 481 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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HOXC11-201ENST00000243082 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 CASZ1Q86V15 1759 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 HAND2P61296 217 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 USP48Q86UV5 1035 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 MRE11P49959 708 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 FGD1P98174 961 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 TAF1P21675 1872 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 PFKFB2O60825 505 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 FBXL16Q8N461 479 aa21.89■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 TCHHQ07283 1943 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 MBD3O95983 291 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 PDCP20941 246 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 APOBRQ0VD83 1088 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 SCRN1Q12765 414 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.88■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 DOCK2Q92608 1830 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF445P59923 1031 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K12Q12852 859 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 CHST3Q7LGC8 479 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 C4BP0C0L5 1744 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF213O14771 459 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 UBE4AQ14139 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 NLRP3Q96P20 1036 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1B0GUL6 1792 aa21.86■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.86■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF3Q9H094 633 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 AIDAQ96BJ3 306 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 RFC4P35249 363 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 EVCP57679 992 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 PHF14O94880 888 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 C4AP0C0L4 1744 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC11-201ENST00000243082 GYG1P46976 350 aa21.84■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 NCOA7Q8NI08 942 aa21.84■■□□□ 1.09
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HOXC11-201ENST00000243082 CTDNEP1O95476 244 aa21.82■■□□□ 1.08
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HOXC11-201ENST00000243082 TM4SF1P30408 202 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 MCM5P33992 734 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 ANTXR2P58335 489 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 PRC1O43663 620 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 MBD4O95243 580 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 ZMYM6O95789 1325 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 FERMT3Q86UX7 667 aa21.8■■□□□ 1.08
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