RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.73■■□□□ 1.07
CBX1-201ENST00000225603 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 JAG2Q9Y219 1238 aa21.72■■□□□ 1.07
CBX1-201ENST00000225603 MED23Q9ULK4 1368 aa21.72■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 TTLL6Q8N841 843 aa21.72■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.71■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.71■■□□□ 1.07
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CBX1-201ENST00000225603 CD209Q9NNX6 404 aa21.7■■□□□ 1.06
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CBX1-201ENST00000225603 SNED1Q8TER0 1413 aa21.69■■□□□ 1.06
CBX1-201ENST00000225603 MAST3O60307 1309 aa21.69■■□□□ 1.06
CBX1-201ENST00000225603 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.68■■□□□ 1.06
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CBX1-201ENST00000225603 MAP4K1Q92918 833 aa21.64■■□□□ 1.06
CBX1-201ENST00000225603 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.64■■□□□ 1.05
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CBX1-201ENST00000225603 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.6■■□□□ 1.05
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CBX1-201ENST00000225603 CYP7A1P22680 504 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 MECOMQ03112 1051 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 MCCP23508 829 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 AOC3Q16853 763 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-201ENST00000225603 GTF2IP78347 998 aa21.59■■□□□ 1.05
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