RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 Q6ZUG5 572 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 GJB2P29033 226 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 FGAP02671 866 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 ADRA2BP18089 450 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 SYT1P21579 422 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 UBE4AQ14139 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 STX6O43752 255 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM37O94972 964 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 NFIXQ14938 502 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.45■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 DTNBO60941 627 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K12Q12852 859 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 TM4SF1P30408 202 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 TCHHQ07283 1943 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 GYG1P46976 350 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 HAND2P61296 217 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 STK3Q13188 491 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 BRF1Q92994 677 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF3C6Q969F1 213 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 NPHP1O15259 732 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 FGD1P98174 961 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 AIDAQ96BJ3 306 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF213O14771 459 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 MTMR6Q9Y217 621 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 F13A1P00488 732 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 GYS1P13807 737 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 CNBD1Q8NA66 436 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 PFKFB2O60825 505 aa20.39■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXL16Q8N461 479 aa20.39■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF3Q9H094 633 aa20.39■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.39■□□□□ 0.86
RABGGTA-201ENST00000216840 MBD4O95243 580 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 APOBRQ0VD83 1088 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 CHST3Q7LGC8 479 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 FSD2A1L4K1 749 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 APPP05067 770 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 ALX1Q15699 326 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PROM2Q8N271 834 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 KLRK1P26718 216 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 SCRN1Q12765 414 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 VPS37DQ86XT2 251 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 NCOA7Q8NI08 942 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 GPT2Q8TD30 523 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 ARMT1Q9H993 441 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMYM6O95789 1325 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PDCP20941 246 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 TXNRD1Q16881 649 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXO41Q8TF61 875 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 EP400Q96L91 3159 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 CHD4Q14839 1912 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 CACNA1SQ13698 1873 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 JAK2O60674 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 MCM5P33992 734 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 GRAPQ13588 217 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms