RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 FUT8Q9BYC5 575 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 PFKFB1P16118 471 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 SYKP43405 635 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 CHMP4BP1P59074 171 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 MYL5Q02045 173 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 E2F4Q16254 413 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.1■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 ATP8B1O43520 1251 aa15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.09■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0G2JLW4 131 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGAP6O43182 974 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 IVLP07476 585 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 ICE2Q659A1 982 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 DEF6Q9H4E7 631 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 FLT4P35916 1363 aa15.08■□□□□ 0.01
ITGA3-201ENST00000007722 ERLIN1O75477 346 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MYL6BP14649 208 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 KCND1Q9NSA2 647 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 GRM8O00222 908 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 TXLNAP40222 546 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 RABGGTAQ92696 567 aa15.08■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 PSME1Q06323 249 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 GOLIM4O00461 696 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 NCAPHQ15003 741 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 SPECC1Q5M775 1068 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 HDXQ7Z353 690 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.07■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 ALDH1L1O75891 902 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MTF1Q14872 753 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 TFCP2Q12800 502 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K9P80192 1104 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 VSTM4Q8IW00 320 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 MED23Q9ULK4 1368 aa15.06■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 ATP2B1P20020 1258 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 CNNM3Q8NE01 707 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.05■□□□□ 0
ITGA3-201ENST00000007722 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 CTR9Q6PD62 1173 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 KSR2Q6VAB6 950 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ABCB6Q9NP58 842 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF827Q17R98 1081 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 PACS2Q86VP3 889 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.05■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC151A5D8V7 595 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 KIF5CO60282 957 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ANO1Q5XXA6 986 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 ATL3Q6DD88 541 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 CLIC6Q96NY7 704 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 KCNJ6P48051 423 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 RGS22Q8NE09 1264 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQ27 194 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQ64 194 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQD8 194 aa15.04■□□□□ -0
ITGA3-201ENST00000007722 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms