RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		V9GY05	133 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM127	O75204	238 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FCN3	O75636	299 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FSHB	P01225	129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GLA	P06280	429 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MGMT	P16455	207 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB3B	P20337	219 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FPR2	P25090	351 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	DUSP1	P28562	367 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR3A1	P47881	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	P2RX3	P56373	397 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	EDDM3B	P56851	147 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB11B	Q15907	218 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		Q6P435	159 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0G2JK05	382 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PSPN	O60542	156 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CA11	O75493	328 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TFF1	P04155	84 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP9	P14780	707 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ARSB	P15848	533 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	EPHA1	P21709	976 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ARF6	P62330	175 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SCN1B	Q07699	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	AIP	O00170	330 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	AVP	P01185	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CALCB	P10092	127 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		Q96M66	194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MPIG6B	O95866	241 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PRTN3	P24158	256 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.66	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms