RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	DEGS1	O15121	323 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	BPNT1	O95861	308 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	UBB	P0CG47	229 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GTF2F2	P13984	249 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MMP9	P14780	707 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CAPZA1	P52907	286 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GPR176	Q14439	515 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	RAB11B	Q15907	218 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TAF9	Q16594	264 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CTF1	Q16619	201 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TPRA1	Q86W33	373 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759		Q8N7P7	452 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	S100A13	Q99584	98 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.31	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759		J3QLI3	93 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ZNF44	P15621	663 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GATA3	P23771	443 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GABRR1	P24046	479 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	PSMD7	P51665	324 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	DLX6	P56179	175 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	NCS1	P62166	190 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ZNF273	Q14593	569 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GRK1	Q15835	563 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CHST4	Q8NCG5	386 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.3	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	NOTO	A8MTQ0	251 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	AIP	O00170	330 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MGST3	O14880	152 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CRLF1	O75462	422 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GABARAP	O95166	117 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MPIG6B	O95866	241 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	CSN2	P05814	226 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	EFNB2	P52799	333 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	DLX1	P56177	255 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	ARF6	P62330	175 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MXD1	Q05195	221 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	AES	Q08117	197 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.29	□□□□□ -0.76
POP4-213	ENST00000592759	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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