RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-215ENST00000592578 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PIFOQ8TCI5 191 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DHDHQ9UQ10 334 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.5□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 C3orf84H3BNL1 204 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SULT1B1O43704 296 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 LMO1P25800 156 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 KISS1Q15726 138 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ZSCAN26Q16670 478 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PLA1AQ53H76 456 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 OR52W1Q6IF63 320 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 LYG1Q8N1E2 194 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CHST4Q8NCG5 386 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 NDNFQ8TB73 568 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 APH1BQ8WW43 257 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DPF1Q92782 380 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 STMN2Q93045 179 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 B9D2Q9BPU9 175 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TCF19Q9Y242 345 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.49□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 E9PI62 339 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 MAGEB3O15480 346 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CHST1O43916 411 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CSN2P05814 226 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 IGLL1P15814 213 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RAB3AP20336 220 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DCKP27707 260 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 MTNR1BP49286 362 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RAB13P51153 203 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DYNLT3P51808 116 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ZP1P60852 638 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SLC35A2P78381 396 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SCN1BQ07699 218 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RNF144BQ7Z419 303 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CORO2AQ92828 525 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 JAM3Q9BX67 310 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TAS2R3Q9NYW6 316 aa11.48□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 IRGMA1A4Y4 181 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 H3BUI4 141 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 DEGS1O15121 323 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CD2P06729 351 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 LIMS3P0CW19 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 LIMS4P0CW20 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 HTR1DP28221 377 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SLC34A1Q06495 639 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 AESQ08117 197 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CCDC58Q4VC31 144 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ZNF691Q5VV52 312 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PXT1Q8NFP0 134 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ZNF596Q8TC21 504 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GPR148Q8TDV2 347 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.47□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ODAMA1E959 279 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 A6NDX4 124 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 MMP23AO75900 390 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 CLIC3O95833 236 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PF4P02776 101 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 PF4V1P10720 104 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GLIPR1P48060 266 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SOX2P48431 317 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 IL18R1Q13478 541 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 TTC23Q5W5X9 447 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ELP2Q6IA86 826 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 Q6P435 159 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 SATL1Q86VE3 508 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 GPER1Q99527 375 aa11.46□□□□□ -0.57
PSME3-215ENST00000592578 C8orf4Q9NR00 106 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms