RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TEX38Q6PEX7 206 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 DHFR2Q86XF0 187 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 TEX12Q9BXU0 123 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 CHST5Q9GZS9 411 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF556Q9HAH1 456 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 A0A087X0M5 115 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1B0GX30 115 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 FUOMA2VDF0 154 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 CDC42P60953 191 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ACTR3P61158 418 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SCN1BQ07699 218 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SPATS1Q496A3 300 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 OR9G1Q8NH87 305 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 RFT1Q96AA3 541 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 COQ2Q96H96 371 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A19Q9HC21 320 aa13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 LYSTQ99698 3801 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 M0R129 80 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GNGT2O14610 69 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SH2D1BO14796 132 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF44P15621 663 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 PRKACGP22612 351 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 RBP2P50120 134 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ATP1B3P54709 279 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GK3PQ14409 553 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 KIR2DS1Q14954 304 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SSX6Q7RTT6 188 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 KIRREL1Q96J84 757 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 HRASLS5Q96KN8 279 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 TBX5Q99593 518 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 HMG20AQ9NP66 347 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 NDE1Q9NXR1 346 aa13.73□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 AP4M1O00189 453 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 PRKYO43930 277 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 SERPINA3P01011 423 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 RAP2AP10114 183 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GLP1RP43220 463 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GNG10P50151 68 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 BNIP1Q12981 228 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GPR50Q13585 617 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 LTC4SQ16873 150 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 CATSPERDQ86XM0 798 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 ADI1Q9BV57 179 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 J3QR06 171 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 GPR12P47775 334 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 MTCP1P56278 107 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 MS4A2Q01362 244 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 MADCAM1Q13477 382 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 HSPB6O14558 160 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV1D-12P01611 117 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 KRT8P05787 483 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 RAB7AP51149 207 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 FOXE3Q13461 319 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 OR8H3Q8N146 312 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 CLN6Q9NWW5 311 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 PSG11Q9UQ72 335 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 SNX3O60493 162 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 CSN2P05814 226 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 REG1BP48304 166 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 FHL3Q13643 280 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 RDH10Q8IZV5 341 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 DNAAF1Q8NEP3 725 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 OR11H1Q8NG94 326 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 LRGUKQ96M69 825 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 SPACA5Q96QH8 159 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 MNTQ99583 582 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 ZMAT4Q9H898 229 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC40-211ENST00000574099 CALYQ9NYX4 217 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms