RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 GYPAP02724 150 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OPN1MWP04001 364 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RLN2P04090 185 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LINC00614P0C842 121 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 AMY2BP19961 511 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RAB3BP20337 219 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ATP6V1B2P21281 511 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 IFNGR2P38484 337 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CEACAM6P40199 344 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RBP2P50120 134 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ARF6P62330 175 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR8B8Q15620 311 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 STUMQ69YW2 141 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GLYATQ6IB77 296 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 WDR82Q6UXN9 313 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.89□□□□□ -1.31
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PALB2-202ENST00000561514 Q8N7P7 452 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR2T4Q8NH00 348 aa6.89□□□□□ -1.31
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PALB2-202ENST00000561514 AP3S1Q92572 193 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LHX4Q969G2 390 aa6.89□□□□□ -1.31
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PALB2-202ENST00000561514 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 KCNJ15Q99712 375 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MED28Q9H204 178 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ALG5Q9Y673 324 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 V9GYQ6 96 aa6.89□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PQ09 198 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C7orf66A4D0T2 115 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GGT3PA6NGU5 568 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF878C9JN71 531 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PDCD5O14737 125 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PRKYO43930 277 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 HLA-DQA2P01906 255 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RAP2AP10114 183 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ARSBP15848 533 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ZNF823P16415 610 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PYCR1P32322 319 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GRK5P34947 590 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MAGEA2P43356 314 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A1P53007 311 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RAB2AP61019 212 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FAM3AP98173 230 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SPIBQ01892 262 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DHODHQ02127 395 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.88□□□□□ -1.31
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PALB2-202ENST00000561514 TRIQKQ629K1 86 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FGFRL1Q8N441 504 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LNX2Q8N448 690 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 OR5R1Q8NH85 324 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 LRRC29Q8WV35 223 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 UBE2FQ969M7 185 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RAB24Q969Q5 203 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 R3HDM4Q96D70 268 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TOR3AQ9H497 397 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.88□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TVP23AA6NH52 213 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 A6NLC8 198 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MARCH11A6NNE9 402 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 PTGES3LE9PB15 166 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 M0R1W7 72 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 ARPC2O15144 300 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TCAPO15273 167 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 FABP3P05413 133 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 TNFSF8P32971 234 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 KIR3DL2P43630 455 aa6.87□□□□□ -1.31
PALB2-202ENST00000561514 RORCP51449 518 aa6.87□□□□□ -1.31
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