RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	GLIPR1	P48060	266 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	CTDSP2	O14595	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	RGS5	O15539	181 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	HPGDS	O60760	199 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR3A1	P47881	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	GPR176	Q14439	515 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61	5e-8	■■□□□ 12.9
UBE2V1-222	ENST00000557021	GNB3	P16520	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM50B	P56557	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-222	ENST00000557021		K7N7A8	449 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHRM2	P08172	466 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	INHBB	P09529	407 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	UBB	P0CG47	229 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF561	Q8N587	486 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		Q8NFD4	153 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CD99	P14209	185 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCL3L1	P16619	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OMG	P23515	440 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	BMX	P51813	675 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	COQ2	Q96H96	371 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MED30	Q96HR3	178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NDUFA2	O43678	99 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CPT2	P23786	658 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARF6	P62330	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF273	Q14593	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LAX1	Q8IWV1	398 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PQ09	198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	HEXA	P06865	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MSMB	P08118	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LTC4S	Q16873	150 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KIF25	Q9UIL4	384 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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