RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR12D2	P58182	307 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ACTC1	P68032	377 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ACTA1	P68133	377 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF85	Q03923	595 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MAB21L1	Q13394	359 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	TMED1	Q13445	227 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MED21	Q13503	144 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SNCB	Q16143	134 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570		Q75L30	129 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SATL1	Q86VE3	508 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RAB39B	Q96DA2	213 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570		R4GMQ9	66 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	HIVEP2	P31629	2446 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CDIPT	O14735	213 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	AKR7A2	O43488	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RP2	O75695	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SULT1C4	O75897	302 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	TTR	P02766	147 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	VPREB1	P12018	145 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MYOD1	P15172	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MYL12A	P19105	171 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CPT2	P23786	658 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ACKR3	P25106	362 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CAPG	P40121	348 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CAPZA1	P52907	286 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CD81	P60033	236 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LMO4	P61968	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	BTG1	P62324	171 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	GNB2	P62879	340 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CSNK2B	P67870	215 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SCN1B	Q07699	218 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZMYND11	Q15326	602 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	RORB	Q92753	470 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-222	ENST00000553570	FGGY	Q96C11	551 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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