RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RAG2P55895 527 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42P60953 191 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GNG3P63215 75 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ACTC1P68032 377 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ACTA1P68133 377 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PAX2Q02962 417 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ARL16Q0P5N6 197 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 AVPI1Q5T686 147 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T2Q6IF00 324 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR52W1Q6IF63 320 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TIGD4Q8IY51 512 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR6V1Q8N148 313 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OTOSQ8NHW6 89 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GIPC3Q8TF64 312 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PP6455Q8WZ26 134 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A10Q96PG2 267 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NMNAT3Q96T66 252 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A7Q99884 636 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR51B6Q9H340 312 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 RERGLQ9H628 205 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C16orf95Q9H693 158 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 WDR76Q9H967 626 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM165Q9HC07 324 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OPN4Q9UHM6 478 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.43□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPQ1 181 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OOSP1A8MZH6 123 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC5O15389 551 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MLNRO43193 412 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GPR137BO60478 399 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MPZL2O60487 215 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SULT1C4O75897 302 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS3O75911 302 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LHBP01229 141 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C1QCP02747 245 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LYNX1P0DP58 116 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SPI1P17947 270 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CEACAM3P40198 252 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OPRL1P41146 370 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 KCNJ3P48549 501 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CX3CR1P49238 355 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DYNLT3P51808 116 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ERVFC1-1P60608 527 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ERVS71-1P61550 626 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ACTA2P62736 377 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ACTG2P63267 376 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MED21Q13503 144 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.42□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 KRT77Q7Z794 578 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.42□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.42□□□□□ -1.86
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