RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	LINC01006	Q8NI28	216 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CORO2A	Q92828	525 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	GHSR	Q92847	366 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	GPER1	Q99527	375 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	SSX3	Q99909	188 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	C16orf95	Q9H693	158 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	VWF	P04275	2813 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0G2JK05	382 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	GPX5	O75715	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TSPAN9	O75954	239 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ARG1	P05089	322 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CD1A	P06126	327 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	BDKRB2	P30411	391 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	WNT4	P56705	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PAX5	Q02548	391 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ODAM	A1E959	279 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PTGFR	P43088	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	OR3A4P	P47883	348 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PROK1	P58294	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	BDH1	Q02338	343 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	AES	Q08117	197 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RIPK1	Q13546	671 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RSU1	Q15404	277 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	THRSP	Q92748	146 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	COQ2	Q96H96	371 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CITED1	Q99966	193 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DEGS1	O15121	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	GLIPR1	P48060	266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	KCNJ3	P48549	501 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	AQP4	P55087	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	SCN1B	Q07699	218 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	OR52W1	Q6IF63	320 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	MMP23A	O75900	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CDK1	P06493	297 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PAX6	P26367	422 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	CD34	P28906	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DYNLT3	P51808	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	DOC2B	Q14184	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	LY6E	Q16553	131 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM28-208	ENST00000495327	PIGY	Q3MUY2	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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