RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM39-238	ENST00000493853	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		F8VVB4	439 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		F8VWA3	439 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		J3QLW9	94 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MGST3	O14880	152 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CHST1	O43916	411 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF737	O75373	536 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ALDOB	P05062	364 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HTR1A	P08908	422 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CALCB	P10092	127 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF19	P17023	458 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ATF1	P18846	271 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DUSP1	P28562	367 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	BRS3	P32247	399 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DLX6	P56179	175 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SCN1B	Q07699	218 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	IL18R1	Q13478	541 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ICAM4	Q14773	271 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF626	Q68DY1	528 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	LYG1	Q8N1E2	194 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PIFO	Q8TCI5	191 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	EME1	Q96AY2	570 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	R3HDM4	Q96D70	268 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RNFT2	Q96EX2	444 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR4F4	Q96R69	305 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CHST6	Q9GZX3	395 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TCF19	Q9Y242	345 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		A6NDX4	124 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		G3V4G9	280 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SIRPB1	O00241	398 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TOR1A	O14656	332 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CD28	P10747	220 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	BCL3	P20749	454 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HTR1D	P28221	377 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	NPBWR2	P48146	333 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF91	Q05481	1191 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	UTS2B	Q765I0	119 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CFHR4	Q92496	578 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SGCD	Q92629	289 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RFT1	Q96AA3	541 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SPSB1	Q96BD6	273 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OPALIN	Q96PE5	141 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF702P	Q9H963	129 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HHLA2	Q9UM44	414 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DEGS1	O15121	323 aa		6.06	□□□□□ -1.44

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