RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RPE	Q96AT9	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM107A	O95990	144 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ATF1	P18846	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PRKACB	P22694	351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	DAP	P51397	102 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	EFNB1	P98172	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	HES1	Q14469	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FKBP6	O75344	327 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SULT1C4	O75897	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF44	P15621	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM11	P17152	192 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	NFYB	P25208	207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RAB25	P57735	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SCN1B	Q07699	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	UTF1	Q5T230	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	COQ2	Q96H96	371 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FGF16	O43320	207 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ZFPL1	O95159	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	CSN2	P05814	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	CCL24	O00175	119 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	KDM4B	O94953	1096 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	OCM2	P0CE71	109 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	HNF4G	Q14541	408 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	STPG2	Q8N412	459 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	PRR25	Q96S07	402 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	ZAR1L	A6NP61	321 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302		J3QR06	171 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	APOL3	O95236	402 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHG2	P01859	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF20	P17024	532 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	BNIP1	Q12981	228 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302		Q6P435	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	FGGY	Q96C11	551 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	ASCL2	Q99929	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKDCC-208	ENST00000490302	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms