RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH3B1P43353 468 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FUT6P51993 359 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CAV3P56539 151 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R43P59537 309 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 VBP1P61758 197 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 BDH1Q02338 343 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MXD1Q05195 221 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 Q499Y3 187 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 SETD6Q8TBK2 473 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 PIGTQ969N2 578 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM106AQ96A25 262 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 TPK1Q9H3S4 243 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CA10Q9NS85 328 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 TREM2Q9NZC2 230 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 F5H5P2 479 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS3O75911 302 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CDRT1O95170 752 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ISG15P05161 165 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CALCBP10092 127 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 VPREB1P12018 145 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 COX6B1P14854 86 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 SERPINB10P48595 397 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 OR10A3P58181 314 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 TLE4Q04727 773 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 GPR50Q13585 617 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 UBE2V2Q15819 145 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZR03 302 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NDNFQ8TB73 568 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HAVCR1Q96D42 359 aa3.95□□□□□ -1.78
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