RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CHRNB4P30926 498 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PMPCAQ10713 525 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 RP1P56715 2156 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DCTDP32321 178 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PTGFRP43088 359 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MEP1BQ16820 701 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 REC114Q7Z4M0 266 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 R4GMQ9 66 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 XKRY2A2RUG3 117 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 CD3DP04234 171 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 STAG3L2P0CL84 134 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 IFITM3Q01628 133 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TESK1Q15569 626 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MS4A18H0YCH9 400 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NMBP08949 121 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TNFSF10P50591 281 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 Q9N2K0 584 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 SLC31A2O15432 143 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PLA2G10O15496 165 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PMP2P02689 132 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 TIGITQ495A1 244 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 AWAT1Q58HT5 328 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TIMP4Q99727 224 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PLK3Q9H4B4 646 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 CLN5O75503 358 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 HSBP1O75506 76 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GABRR1P24046 479 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 IL3RAP26951 378 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 KIR2DS4P43632 304 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GSK3AP49840 483 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 HLA-DRB3P79483 266 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 BAXQ07812 192 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 KIR2DS1Q14954 304 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DRAM2Q6UX65 266 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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